78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2306 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
155 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
136 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  25 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  24.55 
 
 
214 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1883  transcriptional regulator  28.35 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
171 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  24.77 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 
173 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  27.12 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
171 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  36.36 
 
 
146 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
146 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  27.17 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
193 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
157 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  37.31 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  24.58 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1623  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  56.25 
 
 
159 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
154 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
187 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  21.64 
 
 
151 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>