More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1841 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  54.59 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  47.32 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  46.36 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  42.41 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.55 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  46.94 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  41.27 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  44.19 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  44.67 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.62 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.51 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  39.47 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  35.43 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  35.89 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  42.63 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  38.86 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  36.91 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  38.54 
 
 		 223 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  36.62 
 
 		 223 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  38.54 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  38.54 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  37.02 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  39.72 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  40.21 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  37.38 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  43.6 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.34 
 
 		 649 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  37.97 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.44 
 
 		 648 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.29 
 
 		 649 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  35.52 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  35.52 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  39.45 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.29 
 
 		 644 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  36.92 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  37.21 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  39.91 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  36.71 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  37.32 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.38 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  35.89 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  36.15 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  36.62 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  36.11 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  36.84 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  40.98 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  34.29 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  36.82 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  36.84 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  36.84 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  37.07 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  36.84 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  36.49 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  38.83 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.84 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  39.46 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  38.32 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  35.55 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  40 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  34.63 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  41.9 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  35.07 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  37.26 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0028  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 628 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>