197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1736 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  100 
 
 
213 aa  436  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  100 
 
 
213 aa  436  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  54.42 
 
 
184 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  51.25 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  47.22 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  44.76 
 
 
176 aa  137  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  46.2 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  38.68 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  39.05 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  42.94 
 
 
194 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  43.4 
 
 
189 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  43.4 
 
 
189 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  44.94 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  46.85 
 
 
176 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  46.85 
 
 
176 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  41.25 
 
 
207 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  41.25 
 
 
207 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.24 
 
 
207 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  41.25 
 
 
242 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  42 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.49 
 
 
207 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  40.62 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  40.62 
 
 
245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  39.13 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  39.26 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  39.13 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  39.13 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  39.13 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  39.13 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  39.13 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  39.13 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  39.63 
 
 
205 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  37.89 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  35.06 
 
 
193 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  38.85 
 
 
162 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  35.37 
 
 
169 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  35.37 
 
 
183 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  37.32 
 
 
180 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  39.29 
 
 
758 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  34.81 
 
 
177 aa  100  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.76 
 
 
196 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  35.1 
 
 
176 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  35.14 
 
 
176 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  33.09 
 
 
183 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  33.74 
 
 
184 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  37.84 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.52 
 
 
252 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  39.86 
 
 
393 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  33.54 
 
 
404 aa  88.2  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  40.8 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  33.09 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  38.4 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.51 
 
 
363 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.57 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.77 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  31.9 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  36 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  32.14 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  31.9 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  36.64 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  36.64 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  36.64 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  36.64 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  36.64 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  36.64 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  29.31 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  36.64 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1166  hypothetical protein  34.35 
 
 
173 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.112926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4419  hypothetical protein  34.35 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.429401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  33.59 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  32.19 
 
 
355 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.6 
 
 
349 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0795  hypothetical protein  33.59 
 
 
173 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1276  hypothetical protein  33.59 
 
 
173 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  33.9 
 
 
481 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  28.07 
 
 
486 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  31.65 
 
 
487 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1248  hypothetical protein  33.59 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.9 
 
 
486 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  31.29 
 
 
486 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.07 
 
 
486 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  26.89 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  30.43 
 
 
477 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.19 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.97 
 
 
391 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  27.56 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  31.01 
 
 
410 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  32.88 
 
 
356 aa  51.6  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.77 
 
 
484 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
424 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
424 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
424 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  29.8 
 
 
400 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  29.8 
 
 
400 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.51 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  25 
 
 
359 aa  49.3  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  31.4 
 
 
558 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  33.6 
 
 
353 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  29.82 
 
 
439 aa  48.9  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  31.71 
 
 
424 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>