More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1219 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1868    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  32.16 
 
 		 1147 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 1094 aa  364  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 1120 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 1100 aa  336  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  37.08 
 
 		 592 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 1113 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 1100 aa  324  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 1138 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  28.64 
 
 		 1098 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 1172 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 1101 aa  309  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 1112 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 1112 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 1111 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  40.44 
 
 		 578 aa  288  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  38.53 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  36.81 
 
 		 656 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  36.1 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 643 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  31.72 
 
 		 597 aa  164  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 1118 aa  163  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 1132 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  32.57 
 
 		 938 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  22.8 
 
 		 556 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  26.03 
 
 		 861 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.07 
 
 		 861 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.07 
 
 		 861 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.07 
 
 		 861 aa  105  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.07 
 
 		 861 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.07 
 
 		 861 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.57 
 
 		 859 aa  105  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.07 
 
 		 861 aa  105  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.07 
 
 		 861 aa  105  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.57 
 
 		 859 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  21.84 
 
 		 556 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  21.84 
 
 		 556 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  24.07 
 
 		 858 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  23.49 
 
 		 861 aa  100  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  27.63 
 
 		 872 aa  100  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  25.94 
 
 		 851 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  25.7 
 
 		 851 aa  97.8  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  25.5 
 
 		 854 aa  97.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  24.13 
 
 		 568 aa  96.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  25.13 
 
 		 850 aa  95.1  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.77 
 
 		 869 aa  95.1  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  24.55 
 
 		 850 aa  94.7  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.3 
 
 		 844 aa  94  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  26.54 
 
 		 883 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  26.77 
 
 		 850 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  25.4 
 
 		 881 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  26.77 
 
 		 850 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  24.74 
 
 		 850 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  26.77 
 
 		 850 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  21.5 
 
 		 839 aa  92  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  24.92 
 
 		 395 aa  91.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  22.8 
 
 		 863 aa  91.7  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  26.45 
 
 		 850 aa  91.3  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  24.68 
 
 		 863 aa  91.3  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  27.05 
 
 		 484 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  24.6 
 
 		 569 aa  91.3  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  25.48 
 
 		 854 aa  91.3  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  25.41 
 
 		 844 aa  90.9  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  25.69 
 
 		 864 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  23.82 
 
 		 864 aa  89  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  25.62 
 
 		 877 aa  89.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  25.62 
 
 		 877 aa  89.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  24.84 
 
 		 864 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  24.31 
 
 		 844 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  23.65 
 
 		 864 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  22.89 
 
 		 864 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  24.52 
 
 		 850 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  20.82 
 
 		 723 aa  87  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  22.59 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  22.59 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  22.59 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  22.02 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  23.79 
 
 		 850 aa  85.5  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  23.81 
 
 		 866 aa  84.3  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 513 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 513 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  26.25 
 
 		 813 aa  84.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  23.29 
 
 		 850 aa  84.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  22.5 
 
 		 862 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  23.88 
 
 		 867 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  22.97 
 
 		 864 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  22.97 
 
 		 864 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  22.81 
 
 		 840 aa  82  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  24.76 
 
 		 855 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.24 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  24.05 
 
 		 867 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.55 
 
 		 851 aa  79.3  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  24.32 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.32 
 
 		 872 aa  75.5  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  21.75 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  21.75 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>