More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  100 
 
 		 300 aa  578  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 		 344 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 421 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.79 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 423 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.93 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.76 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  32.75 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.6 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.1 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.91 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.97 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.97 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.97 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  28.76 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  25.28 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  34.53 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.3 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.32 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.72 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  24.25 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.98 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.52 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  27.24 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>