235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1395 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 778 aa  1464    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  55.76 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.53 
 
 		 780 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  56.88 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  49.58 
 
 		 761 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.54 
 
 		 832 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  45.6 
 
 		 786 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  54.56 
 
 		 622 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  52.94 
 
 		 582 aa  462  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  46.76 
 
 		 785 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.16 
 
 		 791 aa  452  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  43.68 
 
 		 707 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  45.3 
 
 		 812 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  46.62 
 
 		 764 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  40.69 
 
 		 837 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  40.69 
 
 		 837 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  45 
 
 		 771 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  40.55 
 
 		 837 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  41.31 
 
 		 808 aa  436  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  41.27 
 
 		 822 aa  436  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  40.11 
 
 		 824 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  42.78 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.45 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  44.76 
 
 		 764 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  40.24 
 
 		 860 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  39.33 
 
 		 596 aa  375  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.31 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.68 
 
 		 931 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.09 
 
 		 938 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.62 
 
 		 894 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.71 
 
 		 894 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.87 
 
 		 943 aa  231  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.26 
 
 		 899 aa  230  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.67 
 
 		 902 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  28.97 
 
 		 893 aa  229  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.93 
 
 		 936 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28.52 
 
 		 969 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  26.8 
 
 		 906 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  29.37 
 
 		 941 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  28.09 
 
 		 937 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.85 
 
 		 887 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.26 
 
 		 864 aa  220  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 898 aa  220  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.68 
 
 		 930 aa  217  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 930 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.68 
 
 		 930 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.77 
 
 		 924 aa  215  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.11 
 
 		 900 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.43 
 
 		 934 aa  213  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 934 aa  212  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.53 
 
 		 914 aa  211  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.31 
 
 		 934 aa  210  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  27.56 
 
 		 989 aa  210  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.35 
 
 		 912 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.7 
 
 		 936 aa  208  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.23 
 
 		 933 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.39 
 
 		 931 aa  207  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.5 
 
 		 935 aa  207  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  26.42 
 
 		 928 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  26.42 
 
 		 928 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  27.7 
 
 		 936 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.84 
 
 		 933 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.21 
 
 		 931 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 927 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.36 
 
 		 852 aa  203  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 935 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 930 aa  200  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.74 
 
 		 930 aa  200  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.21 
 
 		 862 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  29.21 
 
 		 862 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.48 
 
 		 949 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.81 
 
 		 895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.16 
 
 		 930 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.18 
 
 		 931 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  26.65 
 
 		 932 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  25.88 
 
 		 968 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  26.63 
 
 		 925 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  28.02 
 
 		 858 aa  197  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  25.55 
 
 		 968 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.09 
 
 		 905 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  27.41 
 
 		 858 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  26.14 
 
 		 928 aa  196  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  27.92 
 
 		 858 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  27.92 
 
 		 858 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  25 
 
 		 891 aa  195  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.24 
 
 		 916 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  25.86 
 
 		 912 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  27.68 
 
 		 858 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  27.68 
 
 		 858 aa  194  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  27.58 
 
 		 858 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  26.48 
 
 		 1029 aa  193  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  24.91 
 
 		 941 aa  193  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.37 
 
 		 900 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 900 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  27.39 
 
 		 899 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  26.68 
 
 		 953 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  25.32 
 
 		 900 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  27.33 
 
 		 858 aa  190  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.09 
 
 		 900 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>