More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0838 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  100 
 
 		 463 aa  934    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  70 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  70.72 
 
 		 462 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  56.42 
 
 		 510 aa  514  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  56.73 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  38.68 
 
 		 459 aa  267  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  36.38 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  35.6 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  34.57 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  36.61 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  37.8 
 
 		 465 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  38.51 
 
 		 499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  36.23 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  39.02 
 
 		 454 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  35.62 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  37.64 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  34.92 
 
 		 457 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.06 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.06 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  35.54 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 490 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  37.61 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  37.61 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  37.61 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  32.31 
 
 		 492 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  32.84 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  33.93 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  33.69 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  33.93 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  33.92 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 578 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 494 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  34.9 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  34.06 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  34.43 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  32.3 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.27 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  29.91 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  29.13 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  32.43 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  32.09 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  32.96 
 
 		 444 aa  153  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  27.58 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  29.54 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.42 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.4 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.27 
 
 		 496 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  26.49 
 
 		 537 aa  93.2  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.84 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.44 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  32.62 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  29.14 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  20.22 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  20.9 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  31.38 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.81 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.78 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.5 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.19 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  24.78 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.26 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  21.53 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  28.57 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  28.19 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  21.78 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  30.23 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  21.58 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.99 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.5 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.06 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  24.23 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.3 
 
 		 592 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.41 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  25.31 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.32 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  50.68 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  28.47 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.29 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  24.77 
 
 		 413 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.4 
 
 		 625 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  21.24 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.29 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.35 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  26.27 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  43.68 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.23 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  31.16 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.18 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.7 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.85 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  29.39 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  45.35 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  35.16 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  44.16 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.18 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.68 
 
 		 624 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>