More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3510 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3510  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000651854  decreased coverage  0.0000592213 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3716  hypothetical protein  72.89 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.102831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3187  hypothetical protein  48.51 
 
 
318 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  29.06 
 
 
316 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.15 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.15 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  28.81 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  26.73 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  26.73 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  26.89 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  28.62 
 
 
332 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  27.3 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  28.28 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  28.36 
 
 
341 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  28.01 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  27.59 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  26.81 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  27.67 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  27.93 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  28.66 
 
 
331 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  25.93 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  27.49 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  29.37 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  28.69 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  29.47 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  25.99 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  27.1 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  28.48 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  28.87 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  27.01 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  27.16 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  27.68 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  28.47 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  29.62 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  23.87 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  26.86 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  26.69 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  26.85 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  28.43 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  26.96 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  27.03 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  26.39 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  26.56 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  27.05 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  28.29 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  30.49 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  23.75 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  26.01 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  28.1 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  27.9 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4218  hypothetical protein  27.8 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  27.59 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  29.02 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  26.46 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  26.35 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  26.88 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  29.36 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  24.6 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  28.57 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  30.36 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  28.08 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  28 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  27.21 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  25.65 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  29.43 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  26.12 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  25.08 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  25.65 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  26.12 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  27.45 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  25.65 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  27 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  28.99 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  26.53 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  28.88 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  26.67 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  29.15 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  29 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  28.26 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  27.64 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  28.16 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  25.94 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  27.21 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  28.52 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  26.28 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  30.19 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5491  extra-cytoplasmic solute receptor  29.41 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  29.08 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  27.01 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  28.85 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  29.08 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  26.28 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  25.93 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  25.89 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>