More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3187 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3187  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3716  hypothetical protein  48.6 
 
 
314 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.102831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3510  hypothetical protein  49.82 
 
 
314 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000651854  decreased coverage  0.0000592213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  31.86 
 
 
330 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  31.23 
 
 
314 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  32.72 
 
 
322 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3076  hypothetical protein  31.66 
 
 
323 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  31.6 
 
 
330 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  32.69 
 
 
320 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  32.09 
 
 
331 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  31.18 
 
 
302 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  31.27 
 
 
327 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  29.93 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  29.1 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  31.82 
 
 
322 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.24 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.04 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  32.18 
 
 
353 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  27.4 
 
 
320 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  31.83 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.86 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.32 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  30.43 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  31.05 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  31.79 
 
 
328 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  30.22 
 
 
331 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  31.29 
 
 
330 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  28.66 
 
 
329 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  29.02 
 
 
322 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  31.83 
 
 
328 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  31.3 
 
 
323 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2875  hypothetical protein  31.3 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  28.77 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  29.93 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  30.38 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  28.53 
 
 
335 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  30.13 
 
 
326 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  29.01 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  29.13 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  27.38 
 
 
333 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  30.33 
 
 
322 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30.17 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  31.29 
 
 
335 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  27.76 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  30.15 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  28.92 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.97 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  29.01 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  28.43 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  26.6 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  26.36 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  30.57 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  30.1 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  31.16 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  30.1 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  31.2 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.37 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  28.66 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  27.7 
 
 
324 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  25.3 
 
 
331 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  25.72 
 
 
328 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  28.53 
 
 
351 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.27 
 
 
318 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  29.78 
 
 
324 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  29.18 
 
 
332 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  29.15 
 
 
345 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  28.81 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  31.56 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  30.45 
 
 
398 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  28.62 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  30.82 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  30.38 
 
 
335 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  28 
 
 
327 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  29.77 
 
 
334 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  27.76 
 
 
322 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2159  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  26.55 
 
 
324 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461923  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  30.46 
 
 
325 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  30.37 
 
 
339 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  27.92 
 
 
332 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  30.18 
 
 
323 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  31.07 
 
 
325 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  31.07 
 
 
325 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  27.63 
 
 
326 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  26.62 
 
 
325 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  28.42 
 
 
338 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  29.12 
 
 
323 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  27.4 
 
 
334 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  29.77 
 
 
320 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  27.45 
 
 
322 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  28.25 
 
 
327 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  27.45 
 
 
322 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  28.87 
 
 
338 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  28.93 
 
 
322 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  25.74 
 
 
330 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  29.58 
 
 
332 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>