More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1593 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1593  BCCT transporter  100 
 
 		 601 aa  1180    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00794806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1486  BCCT transporter  68.22 
 
 		 621 aa  774    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0422  BCCT transporter  65.3 
 
 		 651 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0280485  normal  0.480367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  39.84 
 
 		 526 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  40.46 
 
 		 530 aa  343  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  41.37 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  38.66 
 
 		 573 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  40.64 
 
 		 671 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  39.88 
 
 		 653 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  38.85 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5269  choline transporter  39.8 
 
 		 664 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4827  BCCT transporter  40.16 
 
 		 664 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.767861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  38.1 
 
 		 659 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  37.9 
 
 		 659 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  38.37 
 
 		 666 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  37.95 
 
 		 646 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 538 aa  309  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  37.6 
 
 		 558 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  36.72 
 
 		 667 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  40.89 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  36.27 
 
 		 551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  38 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  35.49 
 
 		 637 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.15 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  36.9 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  36.51 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.15 
 
 		 657 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  36.79 
 
 		 580 aa  303  7.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  35.01 
 
 		 681 aa  303  7.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  38.27 
 
 		 637 aa  303  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.25 
 
 		 681 aa  300  6e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  36.76 
 
 		 545 aa  299  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  37.68 
 
 		 724 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  36.6 
 
 		 661 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  36.59 
 
 		 677 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  37.23 
 
 		 676 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  36.96 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00270  choline transporter of high affinity  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00273  hypothetical protein  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3309  choline transport protein BetT  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  36.59 
 
 		 677 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  35.16 
 
 		 667 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  35.4 
 
 		 667 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  34.7 
 
 		 532 aa  296  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5112  choline/carnitine/betaine transporter  36.76 
 
 		 667 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  37.12 
 
 		 679 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  36.08 
 
 		 546 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  36.18 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  36.62 
 
 		 516 aa  294  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  36.62 
 
 		 516 aa  294  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  36.6 
 
 		 661 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  36.62 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  38.46 
 
 		 524 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  36.62 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  36.62 
 
 		 516 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  35.91 
 
 		 676 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2557  choline transport protein BetT  37.53 
 
 		 677 aa  293  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  36.11 
 
 		 516 aa  293  9e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  36.62 
 
 		 516 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  35.54 
 
 		 665 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  38.1 
 
 		 691 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  37.45 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  38.63 
 
 		 610 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  36.97 
 
 		 684 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  36.84 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  35.74 
 
 		 656 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  34.67 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  35.71 
 
 		 676 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  35.1 
 
 		 600 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  34.49 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  36.22 
 
 		 516 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  36.13 
 
 		 516 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  34.49 
 
 		 504 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3496  choline/carnitine/betaine transporter  37.77 
 
 		 724 aa  290  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.81429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  34.85 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  37.45 
 
 		 676 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  37.25 
 
 		 676 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  36.49 
 
 		 531 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  37.45 
 
 		 676 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  37.45 
 
 		 676 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  37.25 
 
 		 676 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  37.45 
 
 		 716 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  37.45 
 
 		 716 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  36.25 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0253  choline/carnitine/betaine transporter  37.02 
 
 		 667 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.984352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  35.71 
 
 		 673 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  34 
 
 		 582 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0244  choline/carnitine/betaine transporter  36.49 
 
 		 667 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300044  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  36.79 
 
 		 520 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  36.79 
 
 		 520 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  35.52 
 
 		 676 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  35.52 
 
 		 676 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  33.51 
 
 		 505 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  34.31 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  34.31 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  35.94 
 
 		 523 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  34.31 
 
 		 505 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>