More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0014 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  100 
 
 
304 aa  597  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  64.47 
 
 
293 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  57.89 
 
 
286 aa  339  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  41.81 
 
 
279 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
257 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 
270 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  34.14 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 
278 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.91 
 
 
259 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.2 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.27 
 
 
267 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
267 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 
260 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  32 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  32.71 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  33.33 
 
 
261 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
254 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 
277 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 
247 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
271 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 
266 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 
264 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
269 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 
285 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 
285 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
273 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.38 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.22 
 
 
253 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.8 
 
 
253 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
274 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 
259 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  36 
 
 
251 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
268 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
256 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 
266 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 
285 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
269 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
254 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  32 
 
 
275 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 
272 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
290 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.82 
 
 
281 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.53 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30 
 
 
267 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  28 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
269 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  28 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  28 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.22 
 
 
256 aa  96.3  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.22 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
253 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  28.52 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  31.05 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.94 
 
 
255 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.65 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  29.28 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  27.38 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 
242 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  31.72 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  31.72 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 
256 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  31.72 
 
 
274 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.86 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  31.82 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>