More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13140 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  864    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 441 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 448 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 495 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.78 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.81 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.54 
 
 		 427 aa  110  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.32 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.53 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  25.42 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.97 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 425 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.08 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 463 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 463 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.06 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.53 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.53 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 458 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 455 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.94 
 
 		 380 aa  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.8 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.68 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>