293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0514 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  100 
 
 		 326 aa  663    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  69.97 
 
 		 319 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  67.49 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  69.25 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  65.54 
 
 		 321 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  41.88 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  38.12 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  35.58 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  34.25 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  31.8 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  33.03 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  35.42 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  33.03 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.23 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  34.47 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  35.71 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  31.87 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  33.03 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  31.97 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  27.95 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  29.79 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.05 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.63 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  32.23 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  30.91 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  33.11 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  30.49 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  31.31 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  31.91 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  31.68 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  29.32 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  27.83 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  27.13 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  27.83 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  29.1 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  27.66 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  25.16 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  28.62 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  25 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  25.45 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  24.46 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  26.33 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  27.33 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  25 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  28.79 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  27.83 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  27.88 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  23.84 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  26.52 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.23 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.08 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  27.67 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  24.81 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.33 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  26.45 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  24.46 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26.22 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  25.9 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  29.49 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  28.37 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  29.06 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.73 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  27.11 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  27.11 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  28.21 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  27.63 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  25.4 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  25.76 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  27.19 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.24 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  26.41 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  25.78 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.11 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  24.45 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  28.38 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  23.83 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  28 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  23.83 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  25.29 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  28.46 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  22.39 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  26.25 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  24.31 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  24.02 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  29.41 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  28.51 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  24.79 
 
 		 260 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  26.05 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  22.31 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  26.4 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  24.79 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  26.4 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  23.02 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  24.21 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  24.21 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>