More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3171 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
249 aa  517  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 
248 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  55.08 
 
 
233 aa  255  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  53.97 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  51.67 
 
 
243 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  53.25 
 
 
244 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  51.82 
 
 
256 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 
247 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  53.57 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50.67 
 
 
246 aa  225  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  48.31 
 
 
244 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  50.21 
 
 
251 aa  223  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  49.19 
 
 
241 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  42.98 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  43.39 
 
 
259 aa  215  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  48.15 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  47.92 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  48.07 
 
 
249 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  48.1 
 
 
249 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  47.68 
 
 
246 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  48 
 
 
269 aa  208  7e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  47.26 
 
 
249 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  47.98 
 
 
255 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  45.1 
 
 
258 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  43.72 
 
 
244 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.95 
 
 
266 aa  205  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  42.62 
 
 
262 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.18 
 
 
306 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  48.12 
 
 
244 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 
258 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  45.96 
 
 
284 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  44.94 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  47.62 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  44.96 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  46.28 
 
 
250 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  43.95 
 
 
243 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.28 
 
 
251 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  43.29 
 
 
237 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  42.32 
 
 
242 aa  192  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  47.41 
 
 
260 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 
273 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  45.12 
 
 
250 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  41.96 
 
 
264 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 
237 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 
237 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  45.76 
 
 
260 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  43.03 
 
 
245 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  43.72 
 
 
237 aa  185  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  45.41 
 
 
230 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  44.73 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  42.55 
 
 
256 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  45.61 
 
 
245 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 
237 aa  178  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 
243 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  45.02 
 
 
243 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  43.88 
 
 
276 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  41.81 
 
 
259 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 
243 aa  168  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 
273 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 
273 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 
273 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 
273 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 
273 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  39.84 
 
 
279 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 
279 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  39.84 
 
 
279 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 
279 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 
273 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 
273 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 
279 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 
242 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  41.53 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  48.39 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  40.91 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  43.17 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 
278 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  38.7 
 
 
236 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  41.81 
 
 
232 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  38.26 
 
 
236 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  41.53 
 
 
243 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  38.46 
 
 
273 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.44 
 
 
230 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
251 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 
243 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 
240 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  41.28 
 
 
243 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.51 
 
 
247 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 
248 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  40.68 
 
 
243 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  41.56 
 
 
278 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  41.52 
 
 
254 aa  155  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  42.17 
 
 
232 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 
253 aa  155  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  45.74 
 
 
230 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>