42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1213 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  935    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  56.19 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  44.4 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  44.18 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.44 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  30.75 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  28.7 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  30.24 
 
 		 456 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  27.47 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  28.88 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  29.01 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  27.47 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  26.8 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  29.41 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.66 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  30 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  28.3 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.87 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.08 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  26.43 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  26.12 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  24.94 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  26.53 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  26.49 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  25.73 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  26.26 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  26.07 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  26.02 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  25.81 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  25.59 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  24.52 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  25.98 
 
 		 440 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  26.71 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  24.68 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  24.03 
 
 		 442 aa  86.7  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  28.17 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  27.81 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  23.71 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  25.96 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  20.05 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.96 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  21.48 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>