More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4378 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 773 aa  1598    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.73 
 
 		 741 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.45 
 
 		 452 aa  347  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.53 
 
 		 1341 aa  343  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  61.05 
 
 		 452 aa  340  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 780 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.1 
 
 		 1171 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  59.27 
 
 		 751 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.5 
 
 		 1171 aa  317  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 		 441 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  58.3 
 
 		 751 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 441 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 		 933 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.76 
 
 		 554 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.03 
 
 		 712 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.22 
 
 		 839 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.18 
 
 		 619 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.02 
 
 		 360 aa  276  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.31 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.57 
 
 		 458 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 		 408 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 756 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.19 
 
 		 675 aa  260  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 780 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 		 434 aa  250  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 666 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 469 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 701 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 473 aa  237  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 		 1255 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 660 aa  227  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  44 
 
 		 540 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.73 
 
 		 1306 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 635 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 441 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 592 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  43.5 
 
 		 689 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  42.44 
 
 		 553 aa  209  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 441 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  37.54 
 
 		 696 aa  208  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  41.91 
 
 		 552 aa  204  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  43.35 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 930 aa  203  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 409 aa  200  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  42.55 
 
 		 407 aa  194  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.39 
 
 		 869 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  40.87 
 
 		 813 aa  190  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  36.76 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  38.21 
 
 		 542 aa  188  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  33.91 
 
 		 411 aa  187  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 556 aa  187  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  38.52 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.93 
 
 		 869 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  35.66 
 
 		 394 aa  182  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  42.62 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  37.35 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  38.94 
 
 		 246 aa  174  7.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 475 aa  173  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 412 aa  172  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 403 aa  170  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  37.02 
 
 		 465 aa  169  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  36.19 
 
 		 856 aa  168  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  37.97 
 
 		 687 aa  168  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  37.34 
 
 		 471 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  36.51 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 832 aa  164  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 1032 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.77 
 
 		 1051 aa  160  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  38.97 
 
 		 812 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  35.51 
 
 		 740 aa  159  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  32.99 
 
 		 1346 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 656 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 653 aa  157  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 783 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 		 906 aa  154  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.58 
 
 		 1466 aa  153  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 657 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1289 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 604 aa  149  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  49.33 
 
 		 945 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 746 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  46.51 
 
 		 754 aa  147  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 907 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 637 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 371 aa  146  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  32.41 
 
 		 616 aa  145  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1325 aa  145  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  50.67 
 
 		 1248 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.14 
 
 		 823 aa  144  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.348272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  53.38 
 
 		 775 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 530 aa  142  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 1676 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  32.81 
 
 		 617 aa  141  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 1253 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  50.36 
 
 		 1047 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  31.84 
 
 		 579 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>