119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0373 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  50.25 
 
 		 624 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  44.09 
 
 		 1222 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.57 
 
 		 921 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  35.34 
 
 		 743 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.89 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  32 
 
 		 593 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  32.96 
 
 		 1178 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.52 
 
 		 706 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  32.03 
 
 		 363 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  32.03 
 
 		 363 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 821 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.99 
 
 		 726 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.87 
 
 		 555 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.35 
 
 		 553 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.02 
 
 		 837 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.95 
 
 		 835 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.34 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.57 
 
 		 1919 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  35.29 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1108 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.59 
 
 		 818 aa  82.8  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  32.63 
 
 		 558 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.92 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.17 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  35.35 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.99 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  32.3 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.46 
 
 		 1848 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.27 
 
 		 1107 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  31.91 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  35.32 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  33.66 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.83 
 
 		 1679 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.84 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.19 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  33.65 
 
 		 826 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  36.84 
 
 		 546 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  34.34 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.82 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16110  hypothetical protein  29.91 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  32 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  33.77 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  30.69 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  28.63 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  31.88 
 
 		 911 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  31.35 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  34.36 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.41 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  31.17 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  31.9 
 
 		 1408 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  30.96 
 
 		 566 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 		 547 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.48 
 
 		 2816 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  32.46 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36.2 
 
 		 714 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  31.34 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  34.05 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  29.08 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  37.95 
 
 		 14609 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  27.09 
 
 		 558 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 2082 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  27.75 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  27.16 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  34.35 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  26.55 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  31.43 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  27.75 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  33.03 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  35.33 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  33.68 
 
 		 1129 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  34.09 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  29.96 
 
 		 1422 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  26.44 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  37.5 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  31.28 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  26.87 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  26.82 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.84 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.57 
 
 		 776 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  34.38 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.82 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  30.69 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 1410 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 1410 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  29.13 
 
 		 526 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  36.61 
 
 		 900 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  29.29 
 
 		 1207 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.84 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.38 
 
 		 544 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.56 
 
 		 692 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  27.27 
 
 		 533 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 		 658 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  29.41 
 
 		 1312 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  29.45 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.52 
 
 		 618 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>