More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0234 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  86.55 
 
 
290 aa  517  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  86.9 
 
 
290 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  82.41 
 
 
290 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  81.38 
 
 
290 aa  487  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  2.42674e-09 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  82.07 
 
 
290 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  75.86 
 
 
290 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 
293 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 
291 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 
292 aa  353  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  6.0181e-05  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 
292 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 
292 aa  349  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
292 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 
292 aa  336  2e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.31213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
294 aa  332  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 
300 aa  325  4e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 
293 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 
292 aa  318  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
297 aa  315  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
296 aa  314  1e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
291 aa  314  1e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 
290 aa  313  3e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
290 aa  308  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 
292 aa  307  1e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 
292 aa  305  4e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  305  5e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
291 aa  305  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
291 aa  304  1e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
289 aa  303  2e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 
289 aa  303  2e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  53.63 
 
 
295 aa  303  3e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
289 aa  302  4e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  53.15 
 
 
295 aa  302  4e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
292 aa  302  4e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
295 aa  301  6e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
295 aa  301  8e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  55.27 
 
 
292 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
292 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 
294 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 
289 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  52.76 
 
 
302 aa  297  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
291 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  295  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
326 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  54.21 
 
 
291 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
292 aa  295  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
293 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.16742e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  53.74 
 
 
291 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  53.74 
 
 
291 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 
292 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
297 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 
292 aa  292  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  292  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
291 aa  291  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
292 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
292 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
290 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
295 aa  289  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  52.59 
 
 
286 aa  289  5e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.24782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
293 aa  288  5e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
290 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
288 aa  287  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  47.77 
 
 
301 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
294 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  51.06 
 
 
287 aa  286  3e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  53.65 
 
 
292 aa  284  1e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
292 aa  284  1e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
294 aa  284  1e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
292 aa  283  2e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
294 aa  283  2e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
297 aa  283  2e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
289 aa  283  2e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 
292 aa  282  4e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
293 aa  281  7e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
301 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02619e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
319 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  51.36 
 
 
295 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  51.36 
 
 
295 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
291 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
301 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  1.82643e-07 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
296 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
300 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0354  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
295 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572016  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
294 aa  277  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
295 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 
301 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
301 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
300 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>