More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3147 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  65.97 
 
 
147 aa  201  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  63.89 
 
 
147 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  66.19 
 
 
142 aa  196  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  66.19 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  65.49 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0229  NUDIX hydrolase  65.28 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  36 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  36 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.15 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  32.58 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  29.45 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  31.58 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.4 
 
 
347 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  33.88 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
172 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  25.62 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
163 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  37.5 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
187 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  39.18 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  32.73 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.33 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2152  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240953  normal  0.0373419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  29.91 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 
473 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  28.97 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  40 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  28 
 
 
360 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  32.79 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  31.9 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
163 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  28.93 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  34.29 
 
 
530 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  30.65 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  33.6 
 
 
181 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
196 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
236 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
291 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  31.43 
 
 
195 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>