258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2496 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 369 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  58.81 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  56.13 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  57.53 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  58.01 
 
 		 368 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  53.28 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  56.08 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.1 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  53.91 
 
 		 371 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  55.52 
 
 		 368 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  51.1 
 
 		 367 aa  359  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  54.5 
 
 		 380 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  54.17 
 
 		 366 aa  355  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.7 
 
 		 373 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  53.59 
 
 		 370 aa  355  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  53.17 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  53.17 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  53.17 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.57 
 
 		 373 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.57 
 
 		 373 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.57 
 
 		 373 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.57 
 
 		 373 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  53.57 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 366 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.57 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  53.57 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  53.59 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 		 367 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  53.64 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 		 368 aa  347  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  55.8 
 
 		 371 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  55.8 
 
 		 371 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  56.04 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  54.42 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  55.4 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  54.08 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  55.33 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 		 371 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  50.95 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  51.15 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  52.51 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  49.18 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 		 372 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  54.02 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  54.02 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  50.41 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  45.79 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 374 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  47.72 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 		 363 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 371 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  42.48 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  42.74 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 		 447 aa  203  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  33.61 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  37.06 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  34.27 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  29.56 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  29.56 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  40.87 
 
 		 408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  29.44 
 
 		 409 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  36.33 
 
 		 625 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  30.67 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.16 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  30.37 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  31.82 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 496 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  32.55 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 400 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  26.79 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  29.85 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  28.04 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  31.17 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.05 
 
 		 402 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.05 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  31.17 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  29.83 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  31.17 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>