More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3181 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
817 aa  1655  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  40.23 
 
 
793 aa  493  1e-138  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
781 aa  448  1e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1079  Hpt protein  90.69 
 
 
384 aa  436  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57713e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
977 aa  419  1e-115  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  43.93 
 
 
982 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  39.16 
 
 
968 aa  402  1e-110  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  38 
 
 
833 aa  389  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.6 
 
 
853 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.24 
 
 
785 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
764 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  51.4 
 
 
588 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.85994e-13 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 
717 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1199 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  50 
 
 
578 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 
718 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.25842e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
724 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
782 aa  357  4e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
818 aa  353  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
1433 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.32 
 
 
659 aa  352  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.94 
 
 
765 aa  351  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
846 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 
818 aa  344  3e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.7 
 
 
582 aa  341  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
1127 aa  340  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
1226 aa  338  2e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
932 aa  338  2e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.22 
 
 
631 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
633 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.97 
 
 
620 aa  335  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.19 
 
 
1560 aa  333  7e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.63 
 
 
738 aa  333  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.76 
 
 
982 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 
762 aa  332  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.19 
 
 
651 aa  332  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
631 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  40.56 
 
 
736 aa  330  5e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
631 aa  329  1e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
921 aa  328  2e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  42.51 
 
 
794 aa  329  2e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  42.73 
 
 
786 aa  327  4e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
902 aa  327  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
627 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  44.1 
 
 
661 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  43.82 
 
 
1023 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.85 
 
 
645 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
1313 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
759 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
865 aa  322  2e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
643 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  43.76 
 
 
1028 aa  321  4e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 
643 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1195 aa  320  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.6 
 
 
641 aa  320  8e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.12 
 
 
995 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.68 
 
 
544 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.45 
 
 
651 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 
643 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
907 aa  318  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1204 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.52 
 
 
860 aa  318  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 
645 aa  317  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
827 aa  316  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  40.08 
 
 
641 aa  316  1e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 
1791 aa  316  1e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  44.09 
 
 
735 aa  315  2e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
882 aa  315  2e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 
846 aa  314  3e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
895 aa  315  3e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
1068 aa  314  5e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  45.69 
 
 
853 aa  314  5e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
916 aa  313  6e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  34.09 
 
 
755 aa  313  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 
1362 aa  313  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
896 aa  313  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 
1691 aa  313  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1407 aa  313  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  43.62 
 
 
787 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.04 
 
 
777 aa  312  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
873 aa  311  3e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  34.87 
 
 
732 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
969 aa  311  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 
1075 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
1350 aa  310  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  46.82 
 
 
606 aa  309  1e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.16 
 
 
923 aa  310  1e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 
1204 aa  309  1e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.63 
 
 
643 aa  308  2e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
1135 aa  309  2e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
959 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
822 aa  308  4e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  43.34 
 
 
729 aa  307  4e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1222 aa  307  5e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
690 aa  307  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
850 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 
791 aa  306  9e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  42.62 
 
 
900 aa  306  9e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 
947 aa  306  1e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  40.83 
 
 
676 aa  306  1e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>