More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0944 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  871    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  75.41 
 
 		 423 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  67.77 
 
 		 423 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 		 423 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 		 423 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 423 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 423 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 423 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 423 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 423 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 423 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 421 aa  421  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  50.35 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  48.79 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  46.48 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 418 aa  364  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 423 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 418 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 429 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 425 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.58 
 
 		 423 aa  359  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 424 aa  359  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 411 aa  355  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>