182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3399 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  100 
 
 		 424 aa  811    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  66.43 
 
 		 419 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  66.43 
 
 		 419 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  67.79 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  67.79 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  67.55 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  68.26 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  67.07 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  67.07 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  67.07 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  68.43 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  67.07 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  55.05 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  46.83 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  45.84 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  43.36 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  29.23 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  26.4 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  25 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  26.54 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  30.65 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  30.65 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  30.65 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  30.65 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  30.65 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  26.36 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  23.8 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  26.29 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  23.76 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  25 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  26.98 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  28.28 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  28.28 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  22.52 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  22 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  27.1 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  24.64 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  24.64 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  23.41 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  25.91 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  25.91 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  23.65 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  27.02 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  25.51 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  23.51 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  26.7 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  25.63 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  24.5 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  24.39 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  23.32 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  24.39 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  24.04 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  24.39 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  23.95 
 
 		 490 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  25 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  24.72 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  27.6 
 
 		 468 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  33.33 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  25.6 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  31.71 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  24.32 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  26.42 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  32.3 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  30.41 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  26.8 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  25.6 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  27.81 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  26.73 
 
 		 465 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  23.32 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  26.71 
 
 		 458 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1403  high-affinity gluconate transporter  27.54 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.633115  normal  0.430036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1158  gluconate transporter  31.15 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.956779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  24.59 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1347  gluconate transporter family protein  31.15 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1070  Gluconate transporter  27.21 
 
 		 481 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  26.32 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  26.32 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  26.32 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  26.32 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  26.32 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  23.79 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  37.78 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  23.75 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  35.58 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  26.32 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  22.2 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  21.29 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  26.32 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  23.79 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  30.41 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7014  gluconate transporter  22.89 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  hitchhiker  0.00603949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  31.91 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  30.38 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  32.02 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  30.54 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  33.88 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  30.7 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  33.88 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  33.88 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  33.88 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>