More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3102 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  99.8 
 
 		 498 aa  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  99.8 
 
 		 498 aa  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  100 
 
 		 498 aa  976    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  72.54 
 
 		 490 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  99.8 
 
 		 498 aa  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  99.8 
 
 		 498 aa  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  65.09 
 
 		 494 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  56.38 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  51.88 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  39.92 
 
 		 485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  40.21 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  40.27 
 
 		 468 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  39.46 
 
 		 447 aa  262  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  36.67 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  36.26 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  34.39 
 
 		 449 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  32.58 
 
 		 449 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  33.41 
 
 		 447 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  33.71 
 
 		 449 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  35.14 
 
 		 438 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  33.26 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  38.88 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  31.98 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  33.18 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  34.43 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  34.92 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  34.92 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  33.18 
 
 		 447 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  33.96 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  32.96 
 
 		 447 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  33.99 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  37.5 
 
 		 446 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  32.67 
 
 		 450 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  32.67 
 
 		 450 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  32.31 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  36.49 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  32.44 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  32.2 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  32.61 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  31.96 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  31.96 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  32.13 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  32.13 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  32.13 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  32.13 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  32.13 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  32.13 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  32.19 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  34.91 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  38.32 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  35.96 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  32.26 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  32.19 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  32.19 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  32.19 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  32.14 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  35.64 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  33.72 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  35.93 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  34.87 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  33.77 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  32.75 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  34.73 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  34.65 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  34.17 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  33.48 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  33.49 
 
 		 454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  33.26 
 
 		 454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  33.26 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  33.26 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  32.81 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  31.96 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  31.96 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  33.26 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  31.65 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  32.07 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  33.49 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  32.07 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  31 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  33.11 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  35.15 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  31.83 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  33.86 
 
 		 450 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.95 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  32.07 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  36.61 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  31.35 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  31.42 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  37.44 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  35.28 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  33.03 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  37.9 
 
 		 452 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>