More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4175 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  100 
 
 
447 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  99.78 
 
 
447 aa  870    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  99.78 
 
 
447 aa  871    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  99.78 
 
 
447 aa  872    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  57.69 
 
 
445 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  58.47 
 
 
446 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  58.24 
 
 
446 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  58.24 
 
 
446 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  58.47 
 
 
446 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  58.24 
 
 
446 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  58.14 
 
 
446 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  57.56 
 
 
446 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  57.79 
 
 
446 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  51.69 
 
 
448 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  45.63 
 
 
446 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  39.51 
 
 
450 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  39.51 
 
 
450 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  41.43 
 
 
474 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  39.29 
 
 
450 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  38.46 
 
 
450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  38.78 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  38.53 
 
 
448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  38.53 
 
 
448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  38.53 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  38.53 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  38.53 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  38.53 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  39.28 
 
 
450 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  39 
 
 
450 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  38.06 
 
 
450 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  39.29 
 
 
450 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  36.6 
 
 
449 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  37.84 
 
 
450 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  39.26 
 
 
450 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  37.17 
 
 
449 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  37.41 
 
 
477 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  37.23 
 
 
450 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  37.23 
 
 
449 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  36.99 
 
 
449 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.94 
 
 
453 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  35.73 
 
 
452 aa  292  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  35.73 
 
 
452 aa  292  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  35.57 
 
 
452 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  37.17 
 
 
449 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  35.71 
 
 
464 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  39.5 
 
 
450 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  38.04 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  35.58 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  40.5 
 
 
459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  34.85 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  34.94 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  38.53 
 
 
456 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  37.47 
 
 
450 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  34.76 
 
 
438 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  35.88 
 
 
449 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  34.62 
 
 
439 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  34.54 
 
 
438 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  35.88 
 
 
449 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  34.54 
 
 
438 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  35.36 
 
 
463 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  35.36 
 
 
463 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  34.71 
 
 
438 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  35.52 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  35.52 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  34.7 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  40.42 
 
 
458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  36.64 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  36.64 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  35.35 
 
 
449 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  36.64 
 
 
477 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  35.52 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  34.7 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  36.28 
 
 
461 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  35.07 
 
 
453 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  35.78 
 
 
457 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  35.24 
 
 
437 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  34.82 
 
 
469 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  33.85 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  33.85 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  37.5 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  33.85 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  33.85 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  33.85 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  36.43 
 
 
453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  36.43 
 
 
453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  36.43 
 
 
453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  36.24 
 
 
450 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  34.57 
 
 
441 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  36.24 
 
 
450 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  34.57 
 
 
441 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  36.3 
 
 
464 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  37.25 
 
 
474 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  35.97 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>