More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2554 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  100 
 
 
494 aa  969    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  65.09 
 
 
498 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  65.09 
 
 
498 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  65.09 
 
 
498 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  65.09 
 
 
498 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  65.09 
 
 
498 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  63.86 
 
 
490 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  50.32 
 
 
462 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  46.7 
 
 
461 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  41.06 
 
 
485 aa  346  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  40.83 
 
 
487 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  37.8 
 
 
482 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  35.68 
 
 
468 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  36.32 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  36.81 
 
 
446 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  34.45 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  35.42 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  34.29 
 
 
448 aa  219  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  38.08 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  34.32 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  33.33 
 
 
460 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  31.11 
 
 
447 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  31.11 
 
 
447 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  30.89 
 
 
447 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  30.89 
 
 
447 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  32.67 
 
 
449 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  31.33 
 
 
449 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  32.29 
 
 
449 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  32.29 
 
 
449 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  32.07 
 
 
449 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  32.07 
 
 
449 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  34.82 
 
 
452 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  30.04 
 
 
450 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  33.56 
 
 
452 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  31.21 
 
 
462 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  33.8 
 
 
451 aa  200  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  32.8 
 
 
452 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  34.42 
 
 
452 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  34.68 
 
 
452 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  36.26 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  33.03 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  36.19 
 
 
450 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  34.47 
 
 
452 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  34.47 
 
 
452 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  34.47 
 
 
452 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  34.47 
 
 
452 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  33.89 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  32.03 
 
 
452 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  33.73 
 
 
452 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  31.72 
 
 
461 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  34.67 
 
 
452 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  30.72 
 
 
450 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  29.37 
 
 
477 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  31.11 
 
 
452 aa  195  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  35.17 
 
 
450 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  29.48 
 
 
453 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  32.96 
 
 
452 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  31.66 
 
 
441 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  29.71 
 
 
453 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  30.27 
 
 
450 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  31.36 
 
 
441 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  33.26 
 
 
455 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  32.38 
 
 
446 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  31.29 
 
 
459 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  31.73 
 
 
441 aa  190  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  34.01 
 
 
452 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  34.14 
 
 
455 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  30.65 
 
 
450 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  30.52 
 
 
441 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  30.02 
 
 
450 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  30.65 
 
 
450 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  30.65 
 
 
450 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  30.23 
 
 
460 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  33.71 
 
 
474 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  34.01 
 
 
452 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  34.01 
 
 
452 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  30.3 
 
 
441 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  30.3 
 
 
441 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  30.3 
 
 
441 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  29.22 
 
 
445 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  30.3 
 
 
441 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  31.14 
 
 
438 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  33.99 
 
 
460 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  30.07 
 
 
441 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  29.64 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  31.35 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  29.02 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  29.13 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  31.82 
 
 
438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  29.19 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  29.19 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  29.19 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  31.38 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  29.19 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>