267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2593 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  100 
 
 		 421 aa  800    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  75.48 
 
 		 422 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  75.71 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  75.48 
 
 		 422 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  72.86 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  72.86 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  72.86 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  65.87 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  72.86 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  65.87 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  68.26 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  72.32 
 
 		 421 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  53.9 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  45.5 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  44.19 
 
 		 431 aa  343  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  45.84 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  25.32 
 
 		 494 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  27.93 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  25.73 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  25.58 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  25 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  25 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  25 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  24.29 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  24.55 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  25.22 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  25.22 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  25.48 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  25.7 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  27.42 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  26.35 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  23.7 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  23.7 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  24.35 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  23.7 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  23.7 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  26.97 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  26.42 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  25.18 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  27.48 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  25.97 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  23.8 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  24.5 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  26.79 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  25.24 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  24.5 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  25.34 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  24.44 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  25.26 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.69 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.69 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.69 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  23.14 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  23.28 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  24.63 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  24.69 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  24.69 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  26.76 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.69 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  24.69 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  23.86 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  30.27 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  30.27 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  25.99 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  25.68 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  23.38 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  28.63 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  23.38 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  24.29 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  24.29 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  25.1 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  25.1 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  25.1 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  22.9 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  25.1 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  25.1 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  24.46 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  24.46 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  24.42 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  24.46 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  21.88 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  21.88 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  26.77 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1158  gluconate transporter  26.15 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.956779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  22.41 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  25.06 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  26.44 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  23.21 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  32.96 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  21.39 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  23.99 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  26.58 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  21.67 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  24.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  24.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  24.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  24.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  24.3 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>