More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3175 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  100 
 
 
462 aa  898    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  55.68 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  56.38 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  56.38 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  56.38 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  56.38 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  56.38 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  56.07 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  51.22 
 
 
494 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  43.1 
 
 
482 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  42.21 
 
 
487 aa  325  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  42.86 
 
 
468 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  41.57 
 
 
485 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  40.62 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  40.15 
 
 
447 aa  263  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  38.11 
 
 
461 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  37.99 
 
 
460 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  39.36 
 
 
446 aa  254  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  33.71 
 
 
447 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  33.71 
 
 
447 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  33.71 
 
 
447 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  33.71 
 
 
447 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  40.48 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  38.78 
 
 
446 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  36.46 
 
 
453 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  36.62 
 
 
452 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  34.75 
 
 
477 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  34.79 
 
 
455 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  36.36 
 
 
461 aa  226  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  32.66 
 
 
449 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  35.24 
 
 
455 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  37.12 
 
 
452 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  36.47 
 
 
452 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  35.85 
 
 
452 aa  222  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  37.56 
 
 
446 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  35.82 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  33.18 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  33.56 
 
 
449 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  33.78 
 
 
449 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  35.61 
 
 
452 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  36.73 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  36.6 
 
 
452 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  35.15 
 
 
474 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  32.73 
 
 
449 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  31.82 
 
 
450 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  33.1 
 
 
451 aa  216  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  33.64 
 
 
462 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  36.47 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  36.19 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  35.6 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  33.73 
 
 
450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  36.16 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  33.02 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  36.21 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  34.25 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  34.91 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  36.47 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  36.47 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  36.47 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  31.97 
 
 
450 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  32.94 
 
 
450 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  35.57 
 
 
447 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  31.73 
 
 
450 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  32.05 
 
 
450 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  35.62 
 
 
444 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  34.49 
 
 
452 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  31.49 
 
 
450 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  37.38 
 
 
452 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  37.38 
 
 
452 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  32.86 
 
 
450 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  31.49 
 
 
450 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  32.62 
 
 
450 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  35.51 
 
 
459 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  32.8 
 
 
460 aa  206  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  36.92 
 
 
452 aa  203  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  32.47 
 
 
447 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  31.08 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  31.08 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  31.08 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  31.08 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  31.08 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  33.33 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  31.08 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  33.72 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  33.71 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  29.84 
 
 
452 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  34.17 
 
 
460 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  31.17 
 
 
438 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  31.85 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  33.49 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  31.82 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  31.9 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  31.9 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  33.66 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  31.9 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  31.9 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  31.22 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  32.45 
 
 
450 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  31.9 
 
 
446 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  31.83 
 
 
438 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>