297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1070 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1410  Gluconate transporter  72.08 
 
 		 488 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0496328  normal  0.759951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1070  Gluconate transporter  100 
 
 		 481 aa  937    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4481  Gluconate transporter  36.95 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.495728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  30.75 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  30.79 
 
 		 449 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  30.07 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  30 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  29.51 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  30.79 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  29.85 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  29.85 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  31.36 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  31.01 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  29.63 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  29.85 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  30.57 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  31.14 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  29.63 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  29.63 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  29.63 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  30.85 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  31.06 
 
 		 449 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  31.6 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  28.79 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  30.61 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  30.29 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  30.28 
 
 		 461 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  29.24 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  30.25 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  29.24 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  30.02 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  28.01 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  28.5 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  27.27 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  28.53 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  27.63 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  30.18 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  29.83 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  29.49 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  29.5 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  29.32 
 
 		 469 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  30.9 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  30.68 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  28.23 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  27.89 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  30.22 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  27.91 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  27.91 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  30.7 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  30.48 
 
 		 441 aa  156  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  30.26 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  30.26 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  29.1 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  30.48 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  30.36 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  30.04 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  30.04 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  30.04 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  30.98 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  31.63 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  29.26 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  29.26 
 
 		 454 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  29.26 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  29.26 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  29.98 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  29.95 
 
 		 450 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  29.02 
 
 		 454 aa  152  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  29.26 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0685  gluconate transporter  28.42 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0925038  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  30.2 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  27.75 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  27.67 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  31.23 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  28.29 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  27.03 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  29.95 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  29.95 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  29.9 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  29.08 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  30.2 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  27.27 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  28.57 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  29.65 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  29.9 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  29.9 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  29.61 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  28.46 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  28.16 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  30.51 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0652  gluconate transporter  28.22 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  28.76 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  28.63 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  28.15 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  28.87 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0696  gluconate transporter  27.74 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  27.03 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  29.55 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  27.03 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  29.55 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  29.55 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>