298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5329 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  100 
 
 
477 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  100 
 
 
477 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  92.66 
 
 
474 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  99.79 
 
 
477 aa  904    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  89.73 
 
 
476 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  59.07 
 
 
458 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  59.59 
 
 
444 aa  472  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  57.78 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  55.13 
 
 
459 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  62.82 
 
 
458 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  61.28 
 
 
487 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  55.51 
 
 
460 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  57.43 
 
 
460 aa  448  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  57.82 
 
 
458 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  53.48 
 
 
461 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  57.81 
 
 
461 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  56.82 
 
 
467 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  52.83 
 
 
459 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  56.1 
 
 
458 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  55.3 
 
 
467 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  58.69 
 
 
458 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  56.6 
 
 
458 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  51.06 
 
 
472 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  51.45 
 
 
461 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  47.64 
 
 
466 aa  348  8e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  43.67 
 
 
477 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  41.16 
 
 
464 aa  319  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  40.21 
 
 
464 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  38.92 
 
 
485 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  39.63 
 
 
485 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  42.07 
 
 
446 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  36.64 
 
 
447 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  36.64 
 
 
447 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  36.64 
 
 
447 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  36.64 
 
 
447 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  38.95 
 
 
488 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  41.54 
 
 
456 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  39.65 
 
 
448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  40.6 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  40.6 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  40.6 
 
 
454 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  40.6 
 
 
454 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  40.6 
 
 
454 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  40.38 
 
 
454 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  40.17 
 
 
454 aa  269  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  37.03 
 
 
474 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  38.64 
 
 
452 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  37.97 
 
 
465 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  35.71 
 
 
450 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  35.06 
 
 
449 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  40.43 
 
 
472 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  36.83 
 
 
449 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  39.15 
 
 
457 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  36.7 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  36.61 
 
 
449 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  37.88 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  38.66 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  36.64 
 
 
450 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  36.61 
 
 
449 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  36.64 
 
 
450 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  34.45 
 
 
452 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  35.71 
 
 
449 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  35.78 
 
 
465 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  35.46 
 
 
453 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  35.32 
 
 
452 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  35.32 
 
 
452 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  36.38 
 
 
449 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  36.17 
 
 
465 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  35.89 
 
 
453 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.67 
 
 
453 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  34.43 
 
 
438 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  34.9 
 
 
449 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  34.43 
 
 
438 aa  249  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  34.43 
 
 
438 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  38.19 
 
 
502 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  33.33 
 
 
449 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  34.21 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  36.23 
 
 
453 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.23 
 
 
453 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  36.38 
 
 
446 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.23 
 
 
453 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.38 
 
 
446 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.23 
 
 
453 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.23 
 
 
453 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  34.9 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  35.96 
 
 
450 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  35.03 
 
 
453 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  34.21 
 
 
438 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  34.95 
 
 
499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  36.47 
 
 
453 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  36.18 
 
 
453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  36.18 
 
 
453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  36.18 
 
 
453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  35.27 
 
 
453 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  34.52 
 
 
439 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  34.52 
 
 
439 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  34.52 
 
 
439 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  34.52 
 
 
439 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  36.97 
 
 
450 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  34.52 
 
 
439 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>