289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2508 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  100 
 
 		 502 aa  949    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  51.03 
 
 		 472 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  44.09 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  44.56 
 
 		 456 aa  362  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  42.51 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  42.03 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  42.43 
 
 		 454 aa  347  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  42.23 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  42.23 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  42.23 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  42.23 
 
 		 454 aa  346  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  41.83 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  42.71 
 
 		 452 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  39.24 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  38.65 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  38.1 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  38.1 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  38.1 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  39.17 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  38.6 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  37.01 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  36.63 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  37.02 
 
 		 476 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  38.44 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  34.62 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  34.42 
 
 		 447 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  34.42 
 
 		 447 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  34.42 
 
 		 447 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  35.59 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  36.46 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  37.3 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  35.34 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  34.5 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  30.39 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  32.07 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  32.07 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  32.07 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  32.07 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  31.86 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  31.86 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  30 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  30.29 
 
 		 452 aa  213  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  30.29 
 
 		 452 aa  213  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  30.63 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  30.99 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  32.12 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  30.53 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  32.19 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  31.46 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  30.58 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  29.74 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  29.81 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  31.08 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  30.74 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  31.52 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  34.73 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  32.08 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  29.41 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  31.87 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  30.54 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  31.11 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  30.04 
 
 		 449 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  29.83 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  29.62 
 
 		 449 aa  193  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  30.75 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  27.16 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  29.41 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  29.82 
 
 		 453 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  29.82 
 
 		 453 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  29.82 
 
 		 453 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  30.52 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  29.61 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  29.82 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  29.61 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  45.78 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  30.12 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  30.22 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  31.84 
 
 		 482 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  30.33 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  44.05 
 
 		 464 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  30.53 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  29.4 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  29.33 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3704  gluconate transporter  28.69 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7002  gluconate transporter  27.44 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  30.65 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  29.19 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  29.19 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  30.24 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3107  gluconate transporter  30.89 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3032  gluconate transporter  30.6 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0909062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  29.03 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  29.03 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  29.03 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  29.03 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  29.03 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  48.3 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  31.42 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1347  gluconate transporter family protein  31.25 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  27.11 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>