More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3134 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  98.68 
 
 		 454 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  98.9 
 
 		 454 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  98.68 
 
 		 454 aa  863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  80.13 
 
 		 456 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  98.9 
 
 		 454 aa  862    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  100 
 
 		 454 aa  876    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  98.68 
 
 		 454 aa  863    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  98.46 
 
 		 454 aa  862    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  74.01 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  72.47 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  56.47 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  49.35 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  45.23 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  44.93 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  42.03 
 
 		 502 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  43.33 
 
 		 464 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  41.69 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  40.82 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  41.26 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  40.72 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  40 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  40.49 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  40.17 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  40.17 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  39.96 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  39.69 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  37.7 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  37.33 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  39.41 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  37.14 
 
 		 447 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  37.14 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.14 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  36.91 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  40 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  40.04 
 
 		 476 aa  262  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  37.67 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  39 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  38.08 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  36.98 
 
 		 459 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  35.73 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  37.64 
 
 		 461 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  38.13 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  37.75 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  37.73 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  38.8 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  34.34 
 
 		 448 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  34.34 
 
 		 448 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  34.34 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  34.34 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  34.34 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  34.34 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  34.54 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  34.54 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  34.54 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  33.56 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  34.77 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  34.22 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  34.01 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  33.03 
 
 		 453 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  34 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  33.86 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  34 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  33.87 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  33.49 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  34.21 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  33.78 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  34.73 
 
 		 449 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  33.78 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  34.47 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  34.3 
 
 		 446 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  33.63 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  37.97 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  34.47 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  33.88 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  34.24 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  33.41 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  34.24 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  36.87 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  33.78 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  33.48 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  34.22 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  32.13 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  33.8 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  32.13 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  34.55 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  34.24 
 
 		 438 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  33.18 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  33.48 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  33.33 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  35.67 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  33.48 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  33.33 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>