295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2931 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  100 
 
 		 458 aa  866    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  67.66 
 
 		 458 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  67.29 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  70.59 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  65.84 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  66.15 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  67.78 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  67.19 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  66.04 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  66.74 
 
 		 487 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  59.91 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  62.82 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  62.82 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  62.82 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  59.91 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  62.37 
 
 		 474 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  60.57 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  61.41 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  61.92 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  61.71 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  62.11 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  55.53 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  56.34 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  53.36 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  51.12 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  47.28 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  40.97 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  40.65 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  45.67 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  39.14 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  42.08 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  39.42 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  38.76 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  38.76 
 
 		 447 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  38.76 
 
 		 447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  38.76 
 
 		 447 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  39.91 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  39.26 
 
 		 474 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  37.94 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  39.69 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  39.69 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  39.69 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  39.69 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  39.69 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  39.47 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  39.25 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  36.53 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  37.92 
 
 		 445 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  37.19 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  34.91 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  34.91 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  38.22 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  34.49 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  34.83 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  35.45 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  36.3 
 
 		 450 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  34.83 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  34.83 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  34.83 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  35.06 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  34.72 
 
 		 450 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  37.34 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  34.87 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  34.61 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  34.87 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  35.21 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  36.53 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  34.61 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  36.3 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  34.61 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  35.89 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  35.08 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  36.32 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  35.57 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  35.43 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  35.57 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  36.3 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  38.22 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  38.22 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  36.3 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  36.3 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  38.81 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  36.75 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  36.43 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  34.97 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  35.21 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  38.48 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  37.44 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  36.61 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  35.44 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.61 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  37.27 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  37.27 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  35.44 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  37.05 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  37.27 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  35.44 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.61 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.61 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  36.61 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>