289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0506 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  100 
 
 
488 aa  934    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  57.08 
 
 
472 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  49.78 
 
 
452 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  51.3 
 
 
452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  51.96 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  49.57 
 
 
454 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  49.57 
 
 
454 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  49.57 
 
 
454 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  49.57 
 
 
454 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  49.35 
 
 
454 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  49.57 
 
 
454 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  49.35 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  43.2 
 
 
502 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  41.37 
 
 
485 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  41.58 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  39.7 
 
 
459 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  38.86 
 
 
460 aa  292  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  41.39 
 
 
458 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  40.39 
 
 
464 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  40.34 
 
 
464 aa  289  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  39.68 
 
 
460 aa  289  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  37.27 
 
 
461 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  38.22 
 
 
467 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  38.95 
 
 
477 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  38.95 
 
 
477 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  38.74 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  37.28 
 
 
472 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  35.34 
 
 
459 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  39.13 
 
 
461 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  38.95 
 
 
448 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  38.48 
 
 
474 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  36.4 
 
 
444 aa  253  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  38.49 
 
 
467 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  38.03 
 
 
476 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  38.03 
 
 
458 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  37.76 
 
 
477 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  38.58 
 
 
487 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  37.5 
 
 
446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  35.5 
 
 
466 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  39.18 
 
 
458 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  36.83 
 
 
458 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.83 
 
 
453 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  34.39 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  33.86 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  35.19 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  32.59 
 
 
447 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  34.97 
 
 
447 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  34.97 
 
 
447 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  32.67 
 
 
467 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  34.97 
 
 
447 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  33.41 
 
 
452 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  33.41 
 
 
452 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  31.6 
 
 
438 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  33.33 
 
 
448 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  33.33 
 
 
448 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  33.33 
 
 
448 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  33.33 
 
 
448 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  33.33 
 
 
448 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  33.33 
 
 
448 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  31.01 
 
 
438 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  33.03 
 
 
441 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  32.81 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  32.13 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  32.33 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  33.48 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  33.48 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  36.24 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  32.81 
 
 
441 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  32.82 
 
 
441 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  33.71 
 
 
449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  32.82 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  32.82 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  32.81 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  32.74 
 
 
441 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  32.96 
 
 
441 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  32.74 
 
 
441 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  31.31 
 
 
438 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  35.54 
 
 
458 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  31.31 
 
 
438 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  31.38 
 
 
438 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  32.39 
 
 
441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  32.52 
 
 
441 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  32.34 
 
 
465 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  32.58 
 
 
441 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  32.58 
 
 
441 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  33.33 
 
 
449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  33.33 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  32.22 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  31.93 
 
 
449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  32.59 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  32.59 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  32.95 
 
 
449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  32.59 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  32.3 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  33.11 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  29.95 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  29.95 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  29.95 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  29.95 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  29.95 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>