294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0274 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  100 
 
 		 472 aa  895    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  57.08 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  58.03 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  59.1 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  56.47 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  56.68 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  56.47 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  56.47 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  56.47 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  56.47 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  56.25 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  57.6 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  50.7 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  44.12 
 
 		 485 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  43.71 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  40.17 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  39.62 
 
 		 464 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  39.45 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  39.37 
 
 		 461 aa  292  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  38.92 
 
 		 460 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  41.14 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  40.6 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  40.6 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  40.6 
 
 		 477 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  40.22 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  40.22 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  40.72 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  37.53 
 
 		 464 aa  279  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  40.28 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  40.43 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  40.9 
 
 		 476 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  37.86 
 
 		 447 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  37.86 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  37.86 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.86 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  37.47 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  36.05 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  37.25 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  37.31 
 
 		 472 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  35.15 
 
 		 450 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  36.63 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  36.63 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  36.4 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.63 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  38.68 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  37.29 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  37.61 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.81 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  35.35 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  33.71 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  36.29 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  34.97 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  34.97 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  36.63 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  38.36 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  36.63 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  40.64 
 
 		 458 aa  249  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  36.63 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  36.63 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  36.63 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  36.63 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  36.4 
 
 		 447 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  37.37 
 
 		 467 aa  249  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  38.08 
 
 		 458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  39.1 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  32.44 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  34.06 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  32.44 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  38.37 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  32.22 
 
 		 438 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  34.92 
 
 		 450 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  32 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  34.6 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  35.45 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  32.22 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  33.26 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  36.84 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  33.11 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  36.62 
 
 		 446 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  36.15 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  33.7 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  35.01 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  33.77 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  33.77 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  34.38 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  34.38 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  33.77 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  36.15 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  36.15 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  36.58 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  35.37 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  34.06 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>