More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5300 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  100 
 
 		 461 aa  884    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  67.1 
 
 		 460 aa  591  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  72.61 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  64.57 
 
 		 459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  63.1 
 
 		 459 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  66.45 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  62.14 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  64.13 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  64.07 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  55.79 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  55.63 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  55.88 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  58.5 
 
 		 487 aa  448  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  54.58 
 
 		 477 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  54.58 
 
 		 477 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  55.36 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  56.41 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  54.58 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  54.55 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  60.05 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  56.74 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  53.74 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  57.41 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  60.41 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  49.34 
 
 		 466 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  42.99 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  41.7 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  41.39 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  44.15 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  42.33 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.3 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  38.39 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  36.82 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  36.82 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  36.82 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  37.05 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  38.69 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  37.91 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  38.67 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  38.46 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  38.46 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  38.46 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  37.53 
 
 		 474 aa  279  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  38.5 
 
 		 450 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  36.82 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  36.82 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  37.76 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  37.56 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  38.61 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  38.39 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  38.39 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  38.39 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  38.39 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  38.39 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  37.47 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  38.24 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  38.01 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  38.31 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  38.18 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  36.92 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  37.75 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  37.09 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  35.97 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  37.06 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  36.65 
 
 		 465 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  36.9 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  37.13 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  37.06 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  36.94 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  39.48 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  36.9 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  36.9 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  38.21 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  38.24 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  36.67 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  36.67 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  35.96 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  35.96 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  36.6 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.6 
 
 		 449 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  36.67 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  38.78 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  36.67 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  37.47 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  37.47 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  39.17 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  39.17 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  39.17 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  37.39 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  39.17 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  38.64 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  36.47 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>