297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  100 
 
 		 466 aa  894    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  71.24 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  51.55 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  49.88 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  50.66 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  51.03 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  50.45 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  51.15 
 
 		 467 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  47.68 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  47.98 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  47.64 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  47.64 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  47.64 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  50.11 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  51.27 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  45.62 
 
 		 444 aa  364  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  47.12 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  49.2 
 
 		 461 aa  362  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  47.82 
 
 		 487 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  45.6 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  44.95 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  44.81 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  46.89 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  44.69 
 
 		 458 aa  335  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  43.42 
 
 		 458 aa  322  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  39.69 
 
 		 477 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  39.39 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  39.34 
 
 		 446 aa  267  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  36.19 
 
 		 488 aa  266  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  38.01 
 
 		 464 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  38.25 
 
 		 448 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  34.22 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  34.22 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.76 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  35.45 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  36.97 
 
 		 472 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  34.96 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  34.54 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  36.03 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  36.32 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  36.22 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  34.82 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  34.14 
 
 		 463 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  35.04 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  36.56 
 
 		 450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  34.14 
 
 		 463 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  34.37 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  34.37 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  35.52 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  33.86 
 
 		 438 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  34 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  34.43 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  34.43 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  34.43 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  32.43 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  34.15 
 
 		 439 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  34.92 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  34.92 
 
 		 454 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  34.92 
 
 		 454 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  34.92 
 
 		 454 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  34.92 
 
 		 454 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  34.09 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  34.44 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  33.79 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  33.79 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  35.58 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  36.43 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  33.86 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  32.26 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  35.01 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.01 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  34.71 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  33.92 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  34.58 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  34.99 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  34.23 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  34.23 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  34.22 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  34.23 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  32.06 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  32.1 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  34.54 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  34.49 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  35.15 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.15 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.15 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  34 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.15 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  35.15 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  35.44 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  35.44 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  32.5 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  32.5 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  32.5 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  34.67 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  34.67 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  32.5 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  32.5 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  34.01 
 
 		 457 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  35.21 
 
 		 450 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>