More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4018 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  76.87 
 
 
450 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  100 
 
 
453 aa  884    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  93.17 
 
 
453 aa  805    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  76.87 
 
 
450 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  76.59 
 
 
456 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  75.57 
 
 
450 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  70.48 
 
 
453 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  70.26 
 
 
453 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  70.61 
 
 
453 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  70.26 
 
 
453 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  70.26 
 
 
453 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  70.26 
 
 
453 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  70.26 
 
 
453 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  69.6 
 
 
453 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  69.6 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  69.6 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  69.6 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  70.26 
 
 
453 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  69.03 
 
 
465 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  69.25 
 
 
465 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  70.4 
 
 
446 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  70.4 
 
 
446 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  66 
 
 
449 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  69.16 
 
 
453 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  69.16 
 
 
453 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  65.78 
 
 
449 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  65.39 
 
 
449 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  58.16 
 
 
450 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  57.47 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  58.2 
 
 
450 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  56.5 
 
 
449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  56.13 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  56.26 
 
 
449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  54.65 
 
 
450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  54.65 
 
 
450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  56.26 
 
 
449 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  54.65 
 
 
450 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  56.03 
 
 
449 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  55.19 
 
 
450 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3107  gluconate transporter  56.85 
 
 
447 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  53.81 
 
 
450 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  53.81 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  53.45 
 
 
450 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  53.1 
 
 
450 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  54.2 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  54.36 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  53.91 
 
 
450 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  52.81 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  45.54 
 
 
438 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  45.39 
 
 
441 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  45.62 
 
 
441 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  45.62 
 
 
441 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  45.16 
 
 
441 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  45.16 
 
 
441 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  45.16 
 
 
441 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  44.93 
 
 
441 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  44.93 
 
 
441 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  42.51 
 
 
438 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  45.39 
 
 
441 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  45.12 
 
 
441 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  44.9 
 
 
441 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  45.12 
 
 
441 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  45.35 
 
 
441 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  45.85 
 
 
441 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  42.51 
 
 
438 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  42.51 
 
 
438 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  44.55 
 
 
438 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  44.85 
 
 
441 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  45.39 
 
 
441 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  45.16 
 
 
441 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  43.25 
 
 
448 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  43.25 
 
 
448 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  43.25 
 
 
448 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  43.25 
 
 
448 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  42.95 
 
 
438 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  43.25 
 
 
448 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  43.25 
 
 
448 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  45.09 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  45.54 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  45.54 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  45.54 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  45.54 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  42.15 
 
 
452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  42.15 
 
 
452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  44.87 
 
 
438 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  45.31 
 
 
438 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  44.37 
 
 
463 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  44.37 
 
 
463 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  44.37 
 
 
439 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  44.37 
 
 
439 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  44.37 
 
 
439 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  43.22 
 
 
439 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>