298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1136 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  100 
 
 
467 aa  887    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  87.37 
 
 
467 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  64.58 
 
 
460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  69.76 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  66.45 
 
 
461 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  62.12 
 
 
459 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  61.12 
 
 
459 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  62.28 
 
 
458 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  63.15 
 
 
461 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  58.51 
 
 
444 aa  482  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  58.82 
 
 
458 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  59.53 
 
 
458 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  56.48 
 
 
477 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  60.93 
 
 
458 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  56.48 
 
 
477 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  56.48 
 
 
477 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  56.64 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  57.14 
 
 
487 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  55.84 
 
 
474 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  56.71 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  58.37 
 
 
458 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  55.67 
 
 
476 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  58.56 
 
 
458 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  52.74 
 
 
472 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  50.77 
 
 
466 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  43.61 
 
 
477 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  43.5 
 
 
464 aa  342  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  41.83 
 
 
464 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  38.82 
 
 
488 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  39.24 
 
 
447 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  39.24 
 
 
447 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  39.24 
 
 
447 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  39.24 
 
 
447 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  40.44 
 
 
448 aa  289  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  40.95 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  40.52 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  40.31 
 
 
454 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  40.31 
 
 
454 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  40.31 
 
 
454 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  40.31 
 
 
454 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  40.52 
 
 
454 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  40.93 
 
 
456 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  37.56 
 
 
445 aa  279  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  40.09 
 
 
454 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  38.82 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  37.89 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  37.35 
 
 
449 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  37.41 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  37.05 
 
 
453 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  37.82 
 
 
450 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  36.14 
 
 
453 aa  269  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  38.27 
 
 
439 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  37.26 
 
 
452 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  38.27 
 
 
439 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  37.41 
 
 
465 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  37.92 
 
 
453 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  38.27 
 
 
439 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  38.27 
 
 
439 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  37.92 
 
 
453 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  38.27 
 
 
439 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  37.92 
 
 
453 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  38.44 
 
 
438 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  39.47 
 
 
452 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  36.57 
 
 
449 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  36.57 
 
 
449 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  37.58 
 
 
453 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  38.08 
 
 
450 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.01 
 
 
449 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  36.34 
 
 
449 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  38.44 
 
 
438 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  37.99 
 
 
438 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  37.53 
 
 
453 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  36.24 
 
 
449 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  38.15 
 
 
453 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  38.44 
 
 
438 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.15 
 
 
453 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  37.76 
 
 
438 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  36.24 
 
 
449 aa  263  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  38.06 
 
 
453 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  36.99 
 
 
446 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  38.15 
 
 
446 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  36.24 
 
 
449 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.15 
 
 
453 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.15 
 
 
446 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.15 
 
 
453 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  38.15 
 
 
453 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  37.07 
 
 
452 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  37.07 
 
 
452 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  36.53 
 
 
446 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  38.72 
 
 
438 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  38.95 
 
 
439 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  36.53 
 
 
446 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>