293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04131 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  100 
 
 		 439 aa  853    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  94.08 
 
 		 439 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  99.77 
 
 		 439 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  94.31 
 
 		 463 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  78.36 
 
 		 439 aa  693    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  94.31 
 
 		 439 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  853    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  99.54 
 
 		 439 aa  847    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  99.77 
 
 		 439 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  94.31 
 
 		 439 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  94.31 
 
 		 463 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  61.19 
 
 		 438 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  60.96 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  61.33 
 
 		 438 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  61.19 
 
 		 438 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  60.73 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  61.87 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  62.1 
 
 		 438 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  61.64 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  61.42 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  60.96 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  61.19 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  61.19 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  60.96 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2768  gluconate transporter  59.68 
 
 		 444 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  49.54 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  49.54 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  49.54 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  49.54 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  49.54 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  49.54 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  48.58 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  46.95 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  46.95 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2470  gluconate transporter  45.54 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  47.32 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  47.51 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  45.56 
 
 		 437 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7002  gluconate transporter  44.81 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3704  gluconate transporter  48.55 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  46.17 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  42.25 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  43.38 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  45.45 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  41.89 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  45.22 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  45.22 
 
 		 449 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  45.22 
 
 		 449 aa  359  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  44.89 
 
 		 449 aa  359  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  45.22 
 
 		 449 aa  358  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  44.19 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  44.19 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  43.95 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  43.94 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  43.72 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  43.49 
 
 		 450 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  44.09 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  43.49 
 
 		 450 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  44.19 
 
 		 450 aa  348  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  44.1 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  43.65 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  40 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  43.65 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  43.82 
 
 		 450 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  43.05 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  43.43 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  43.43 
 
 		 453 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  43.43 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  43.43 
 
 		 453 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  43.43 
 
 		 453 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  43.26 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  42.38 
 
 		 453 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  43.36 
 
 		 465 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0795  gluconate transporter  46.13 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.820919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  43.47 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  44.29 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  40.46 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  43.16 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  43.16 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  40.58 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  40.58 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  40.58 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  42.92 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  41.03 
 
 		 453 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  42.14 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1403  high-affinity gluconate transporter  40.33 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.633115  normal  0.430036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>