297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4498 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  100 
 
 
445 aa  867    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  75 
 
 
446 aa  627  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  73.87 
 
 
446 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  73.42 
 
 
446 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  73.65 
 
 
446 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  73.65 
 
 
446 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  73.65 
 
 
446 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  72.52 
 
 
446 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  72.75 
 
 
446 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  57.69 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  57.69 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  57.69 
 
 
447 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  57.47 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  46.44 
 
 
448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  40 
 
 
446 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  40.71 
 
 
450 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  39.95 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  39.95 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  39.95 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  38.53 
 
 
450 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  38.3 
 
 
450 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  36.67 
 
 
449 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  38.22 
 
 
450 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  35.03 
 
 
452 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  38.55 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  36.67 
 
 
450 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  36.52 
 
 
477 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  34.55 
 
 
438 aa  266  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  34.55 
 
 
438 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  34.55 
 
 
438 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  38.55 
 
 
450 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  39.22 
 
 
458 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  37.23 
 
 
449 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  36.9 
 
 
449 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  36.52 
 
 
449 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  36.75 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  37.91 
 
 
450 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  39.46 
 
 
459 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  39.81 
 
 
450 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.52 
 
 
449 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  34.46 
 
 
452 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  34.46 
 
 
452 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  39.12 
 
 
450 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  35.17 
 
 
453 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.7 
 
 
464 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  35.93 
 
 
448 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  35.93 
 
 
448 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  35.93 
 
 
448 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  35.93 
 
 
448 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  35.93 
 
 
448 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  35.93 
 
 
448 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  40.09 
 
 
450 aa  256  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  33.73 
 
 
438 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.25 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  37.14 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  36.07 
 
 
474 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  36.38 
 
 
449 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  37.27 
 
 
460 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  35.16 
 
 
449 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  38.01 
 
 
458 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  35.39 
 
 
449 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  35.48 
 
 
464 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  37.01 
 
 
460 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  36.26 
 
 
458 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  35.12 
 
 
465 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  33.41 
 
 
438 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  34.79 
 
 
465 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  36.64 
 
 
467 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  39.3 
 
 
444 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  34.25 
 
 
439 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  32.95 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  34.75 
 
 
450 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  36.7 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  32.94 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  36.7 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  32.94 
 
 
439 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  32.94 
 
 
439 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  32.94 
 
 
439 aa  246  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  32.94 
 
 
439 aa  246  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  36.94 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  36.55 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  35.14 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  36.48 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  33.26 
 
 
457 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  34.84 
 
 
438 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  34.75 
 
 
441 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  34.72 
 
 
485 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  35.28 
 
 
441 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  34.75 
 
 
465 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  33.41 
 
 
438 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  33.64 
 
 
438 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  33.41 
 
 
438 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  33.41 
 
 
438 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>