More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2523 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  77.18 
 
 		 450 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  99.56 
 
 		 450 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  87.05 
 
 		 450 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  78 
 
 		 450 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  86.44 
 
 		 450 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  80 
 
 		 450 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  79.33 
 
 		 450 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  100 
 
 		 450 aa  873    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  97.33 
 
 		 450 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  80.89 
 
 		 450 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  80.67 
 
 		 450 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  79.78 
 
 		 450 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  100 
 
 		 450 aa  873    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  55.48 
 
 		 453 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  54.57 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  55.71 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  55.09 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  56.48 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  56.02 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  56.02 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  56.02 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  54.55 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  56.54 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  55.48 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  55.5 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  54.08 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  54.08 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  53.74 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  53.76 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  53.76 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  53.76 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  53.76 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  53.98 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  53.76 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  52.21 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  54.71 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  51.98 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  54.51 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  53.86 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  53.17 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  53.76 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  54.08 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  54.71 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  54.51 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  54.08 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  54.08 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  52.09 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  52.8 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  47.64 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  47.64 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  48.09 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  48.09 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  47.87 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  47.64 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  49.78 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  47.42 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  47.42 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  50 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  50.23 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  48.76 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  49.55 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  49.55 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  49.32 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  49.55 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  49.66 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  46.98 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  46.05 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  47.17 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3107  gluconate transporter  48.05 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  46.88 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  46.74 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  46.88 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  46.05 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  46.05 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  45.81 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  47.57 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  47.36 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  47.21 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  47.21 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  47.21 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  48.76 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  47.22 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  47.21 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  44.29 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  46.98 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  44.76 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  44.76 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  44.19 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  44.29 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  44.19 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  44.76 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  44.19 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>