More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3529 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  100 
 
 		 467 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  87.37 
 
 		 467 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  65.23 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  68.9 
 
 		 460 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  62.34 
 
 		 459 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  64.07 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  62.64 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  60.35 
 
 		 459 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  62.72 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  58.61 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  58.04 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  57.52 
 
 		 458 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  61.16 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  58.84 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  55.3 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  55.3 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  55.3 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  58.46 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  55.23 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  58.37 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  56.48 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  53.96 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  57.96 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  53.07 
 
 		 472 aa  428  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  49.67 
 
 		 466 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  45.56 
 
 		 477 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  44.4 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  41.39 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.67 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  37.67 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  37.67 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  37.67 
 
 		 447 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  40.18 
 
 		 448 aa  286  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  41.33 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  38.49 
 
 		 488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  37.5 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  38.19 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  37.13 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  39.29 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  39.29 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  39.29 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  39.29 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  39.29 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  39.29 
 
 		 446 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  39.29 
 
 		 446 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  38.67 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  39.43 
 
 		 454 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  39.59 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  39.43 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  38.6 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  39.22 
 
 		 454 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  39.22 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  40.04 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  39.91 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  39.22 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  39.22 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  40.09 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  39.86 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  38 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  38.22 
 
 		 438 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  39 
 
 		 454 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  37.7 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  38.04 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  38.04 
 
 		 439 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  38.04 
 
 		 439 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  38.22 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  38.04 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  38.04 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  37.03 
 
 		 452 aa  269  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  38.99 
 
 		 453 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  39.64 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  37.67 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  37.5 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  39.64 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  39.64 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  39.64 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  37.99 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  37.47 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  37.53 
 
 		 474 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  37.53 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  37.53 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  39.64 
 
 		 463 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  36.82 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  39.64 
 
 		 463 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  39.64 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  39.64 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  36.57 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  37.44 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  37.44 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  37.44 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  37.76 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  36.98 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>