299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3004 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  100 
 
 		 464 aa  891    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  62.04 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  44.84 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  41.14 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  44.59 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  42.2 
 
 		 459 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  43.15 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  41.16 
 
 		 477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  41.16 
 
 		 477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  41.16 
 
 		 477 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  39.52 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  45.27 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  41.51 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  40.14 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  41.16 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  41.39 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  41.46 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  40.5 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  40.83 
 
 		 467 aa  312  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  42.46 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  39.96 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  39.96 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  39.96 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  40.34 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  41.11 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  39.77 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  39.26 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  40.27 
 
 		 449 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  40.09 
 
 		 449 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  39.77 
 
 		 449 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  39.73 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  39.54 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  39.74 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  40.18 
 
 		 449 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  38.46 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  39.24 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  39.96 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  39.51 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  40.22 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  39.96 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  38.96 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  40.35 
 
 		 446 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  40.35 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.35 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.35 
 
 		 446 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.35 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.35 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.35 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  39.91 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  38.06 
 
 		 453 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  40.09 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  41.56 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  41.56 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  41.56 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  41 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  41.56 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  38.19 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  40.36 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  40.78 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  39.56 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  41.13 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  36.94 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  38.89 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  36.94 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  36.94 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  36.94 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  40.52 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  39.11 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  38.67 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  39.18 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  39.59 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  39.25 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  39.02 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  36.9 
 
 		 446 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  39.68 
 
 		 441 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  39.91 
 
 		 450 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  39.02 
 
 		 441 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  40 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  38.21 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  38.8 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  38.77 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  38.77 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  36.45 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  36.45 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  36.45 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  38.11 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  38.22 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  36.45 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  38.22 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  38.75 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  38.58 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  38.21 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  38 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  36.67 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  38.8 
 
 		 441 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  38.8 
 
 		 441 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  39.78 
 
 		 452 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  38.74 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  38.74 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  39.07 
 
 		 458 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>