297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4040 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  100 
 
 		 477 aa  896    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  48.65 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  45.35 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  45 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  47.84 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  49.76 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  43.9 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  46.85 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  44.62 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  45.58 
 
 		 458 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  44.12 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  42.89 
 
 		 459 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  42.92 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  45.58 
 
 		 458 aa  338  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  45.43 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  42.92 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  46.9 
 
 		 487 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  44.9 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  45.37 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  43.81 
 
 		 467 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  44.96 
 
 		 467 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  43.57 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  43.57 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  43.57 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  43.84 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  43.98 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  40.55 
 
 		 459 aa  317  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  46.48 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  39.44 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  39.86 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  37.81 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.58 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  37.58 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  37.36 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  39.2 
 
 		 449 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  38.51 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  39.2 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  39.1 
 
 		 449 aa  292  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  37.76 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  38.77 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  38.77 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  38.77 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  38.77 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  38.39 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  40.05 
 
 		 472 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  36.68 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  42.15 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  42.15 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  42.15 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  42.15 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  42.15 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  41.93 
 
 		 454 aa  279  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  41.9 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  41.69 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  39.51 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  37.15 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  36.67 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  38.05 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  38.05 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  38.05 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  37.47 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  39.62 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  37.01 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  41.07 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  35.37 
 
 		 439 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  36.98 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  35.37 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  36.47 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  37.2 
 
 		 441 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  35.37 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  35.37 
 
 		 439 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  35.37 
 
 		 439 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  36.71 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  36.71 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  36.98 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  36.96 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  37.15 
 
 		 438 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  36.47 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  40.13 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  36.71 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4970  gluconate permease  36.23 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  36.49 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  36.98 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  36.71 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  38.95 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  36.74 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  36.74 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  36.74 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  36.92 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  39.04 
 
 		 485 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  35.65 
 
 		 463 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>