295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  100 
 
 		 460 aa  880    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  67.25 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  67.1 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  68.7 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  65.23 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  64.58 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  62.75 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  59.74 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  61.44 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  56.81 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  55.23 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  55.86 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  60.79 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  55.51 
 
 		 477 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  55.51 
 
 		 477 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  55.51 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  59.29 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  55.43 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  57.67 
 
 		 487 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  55.82 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  55.41 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  54.04 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2664  putative gluconate permease  56.16 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.909443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  52.21 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00590  gluconate transporter  50.77 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00877233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  43.25 
 
 		 464 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  41.14 
 
 		 464 aa  339  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  43.13 
 
 		 477 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  42.02 
 
 		 448 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  38.86 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  40.87 
 
 		 446 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  37.64 
 
 		 447 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  37.64 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  37.64 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.64 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  37.53 
 
 		 449 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  37.3 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  37.05 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  37.09 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  37.78 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  37.56 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  37.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  37.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  37.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  37.56 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  37.33 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  38.29 
 
 		 472 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  37.78 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  38.67 
 
 		 469 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  36.3 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  35.92 
 
 		 450 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  36.53 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  38.16 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  35.49 
 
 		 474 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  34.98 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  38.16 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  37.88 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  35.16 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  35.16 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  36.34 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  35.27 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  35.86 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  35.33 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  35.1 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  38.29 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  35.33 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  36.5 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  36.26 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  33.72 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  36.26 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  36.26 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  33.56 
 
 		 441 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  33.33 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  33.33 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  33.33 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  33.56 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  38.8 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  33.33 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  36.03 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  36.36 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  35.8 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  35.8 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  35.14 
 
 		 453 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  35.14 
 
 		 453 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  37.39 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  37.3 
 
 		 450 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  35.14 
 
 		 453 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  36.24 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  35.35 
 
 		 453 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  35.33 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>