More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1488 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  80.79 
 
 		 454 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  80.35 
 
 		 454 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  80.79 
 
 		 454 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  80.4 
 
 		 452 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0114  inner membrane permease YgbN  79.07 
 
 		 452 aa  646    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  81.02 
 
 		 454 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  100 
 
 		 456 aa  865    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  80.79 
 
 		 454 aa  671    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  80.79 
 
 		 454 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  80.57 
 
 		 454 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0274  inner membrane permease YgbN  59.1 
 
 		 472 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0506  inner membrane permease YgbN  51.96 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  46.49 
 
 		 485 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  46.49 
 
 		 485 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2508  gluconate transporter  44.27 
 
 		 502 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  42.46 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  44.75 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  42.24 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  42.23 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  42 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  41.54 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  41.54 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  41.33 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  42.25 
 
 		 446 aa  285  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  41.27 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  41.72 
 
 		 476 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  39.63 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  37.77 
 
 		 460 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  40.65 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  40.31 
 
 		 458 aa  276  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  38.07 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  39.81 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  41.16 
 
 		 474 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  37.5 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  37.5 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  37.5 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  37.5 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  40.04 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  41.53 
 
 		 458 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  39.72 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  37.61 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  35.95 
 
 		 472 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  38.41 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  39.68 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3894  gluconate transporter  40.17 
 
 		 487 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320954  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  35.87 
 
 		 450 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  35.87 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  35.87 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  39.21 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  33.56 
 
 		 453 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  36.59 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  36.59 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  36.59 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  36.59 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  36.59 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  36.59 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  34.4 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  36.78 
 
 		 450 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  36.7 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  34.07 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  37.3 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  33.55 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  33.55 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  34.47 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  246  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  35.57 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  33.92 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  34.48 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  35.53 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  35.94 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  34.7 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  36.16 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  35.76 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  35.71 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  35.76 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  35.76 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  35.52 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  35.96 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  35.52 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  36.26 
 
 		 449 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  34.47 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  35.29 
 
 		 441 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  36.34 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  35.29 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  35.29 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4498  gluconate transporter  35.62 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  33.18 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  36.82 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  35.07 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3942  gluconate transporter  39.65 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  35.11 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  35.82 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  35.07 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>