295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3704 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3704  gluconate transporter  100 
 
 		 449 aa  875    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  61.92 
 
 		 448 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  57.49 
 
 		 448 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  57.49 
 
 		 448 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  57.49 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  57.49 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  57.49 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  57.49 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  55.16 
 
 		 452 aa  491  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  55.58 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  55.58 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  51.22 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  51.22 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  51.22 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  49.44 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  48.55 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  47.97 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  47.66 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  48.55 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  48.55 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  48.55 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  48.55 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  48.78 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  49.44 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  49.44 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  48.78 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  48.78 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  48.78 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  46.07 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  49.22 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  48.78 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  49 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  50.11 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  48.55 
 
 		 439 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  48.55 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2768  gluconate transporter  48.69 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0795  gluconate transporter  49.19 
 
 		 378 aa  358  8e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.820919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  41.42 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  39.77 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  39.22 
 
 		 434 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2470  gluconate transporter  40.93 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  39.55 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  41.76 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  43.28 
 
 		 450 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  40.27 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  41.15 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  39.68 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  40.6 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  40.52 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  43.02 
 
 		 450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  41.54 
 
 		 453 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.54 
 
 		 453 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  40.96 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  40.04 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0553  H+/gluconate symporter related permease  42.36 
 
 		 456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  40.04 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  40.04 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  41.32 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.32 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.32 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.32 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  41.32 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  40.31 
 
 		 453 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  41.23 
 
 		 450 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  39.72 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  39.64 
 
 		 449 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  42.82 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  39.64 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  40.36 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  42.6 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  41.82 
 
 		 450 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  40.39 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  40.39 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  40.87 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  42.12 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  42.12 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  41.69 
 
 		 450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  38.91 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  39.41 
 
 		 449 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  39.24 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7002  gluconate transporter  39.5 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  39.45 
 
 		 465 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  38.89 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  38.2 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  40.19 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  37.36 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  40.5 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  40.92 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4303  gluconate transporter  39.03 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  39.03 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>