297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0464 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  100 
 
 		 446 aa  871    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  60 
 
 		 452 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  59.02 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  59.02 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  59.68 
 
 		 452 aa  498  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  60.53 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  59.56 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  58.67 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  59.42 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  59.42 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  59.42 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  59.42 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  60.58 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  57.73 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  61.99 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  59.42 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  59.42 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  59.2 
 
 		 452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  57.94 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  58.18 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  52.56 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  57.08 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  53.42 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  51.63 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  50 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  51.53 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  49.77 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  48.39 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  46.09 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  48.48 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  45.03 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  44.88 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  44.92 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  43.43 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  39.73 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  38.78 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  39.33 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  39.45 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  39.62 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  36.77 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  35.6 
 
 		 487 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  35.25 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  35.67 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  35.67 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  35.67 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  35.67 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  35.67 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  35 
 
 		 485 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  37.68 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  32.13 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  38.08 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  32.47 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.41 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  32.04 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.59 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  32.62 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  32.64 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  30.89 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  32.2 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  31.56 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  31.56 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  31.56 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  31.56 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  32.2 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  31.97 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  31.97 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  31.97 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  31.35 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  31.56 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  32.67 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  31.56 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  32.56 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  30.98 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  30.4 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  31.44 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  29.07 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  30.98 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  31.34 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  29.07 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  29.07 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  29.07 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  30.54 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  31.69 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  30.98 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  29.44 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  31.54 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  31.22 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  32.36 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  30.44 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  32.37 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  29.45 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  30.57 
 
 		 458 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  30.5 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  30.5 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  30.5 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  30.5 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  31.84 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  30.5 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  30.5 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0108  inner membrane permease YgbN  31.6 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>