More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1252 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  69.57 
 
 		 447 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  100 
 
 		 447 aa  872    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  53.44 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  50.68 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  50.11 
 
 		 452 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  53.91 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  49.45 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  49.55 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  49.31 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  46.95 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  50.68 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  50.83 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  48.68 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  49.12 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  48.68 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  48.46 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  48.24 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  44.91 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  46.65 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  49.1 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  48.24 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  48.24 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  49.12 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  47.79 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  50.8 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  48.68 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  48.68 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  48.68 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  46.95 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  45.27 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  43.59 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  43.27 
 
 		 460 aa  328  9e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  42.83 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  43.31 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  40.44 
 
 		 451 aa  306  6e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  39.87 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  40.99 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  40.66 
 
 		 462 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  41.19 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  36.92 
 
 		 468 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  38.36 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  38.36 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  38.36 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  38.36 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  38.36 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  38.43 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  34.64 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  34.62 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  34.87 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  37.11 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  32.21 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  32.21 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  32.21 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  36.74 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  32.21 
 
 		 447 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  35.71 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  35.71 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  36.14 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  35.32 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  36.97 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  38.46 
 
 		 490 aa  219  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  35.58 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  35.66 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  36.26 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  36.02 
 
 		 450 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  35.55 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  33.02 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  34.22 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  36.19 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  32.79 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  35.21 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  32.56 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  32.56 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  34.78 
 
 		 465 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  32.33 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  35.78 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  32.33 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  32.08 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  33.33 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  35.12 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  35.24 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  32.33 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  32.33 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  34.94 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  35.2 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  33.83 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  34.15 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  32.95 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  33.02 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  35.51 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  35.11 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  35.4 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  34.09 
 
 		 453 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  35.11 
 
 		 449 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  33.5 
 
 		 485 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  30.8 
 
 		 445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  33.88 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  30.72 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  30.72 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  30.72 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>